Wojskową karierę rozpoczynał w Żurawicy
Generał Kowalik swoją wojskową służbę rozpoczynał w Żurawicy w 3 batalionie czołgów 14. Brygady Pancernej – był tam dowódcą plutonu pancernego. Następnie objął stanowisko dowódcy kompanii czołgów tej jednostki, a w roku 2000 został wyznaczony na stanowisku szefa sekcji w 1 batalionie czołgów 21 Brygady Strzelców Podhalańskich.
Służył w USA, teraz dowodzi wielonarodową dywizją NATO
Z tą jednostką związany był w następnych latach. W sierpniu 2014 objął stanowisko szefa sztabu podhalańczyków, którym był do stycznia 2018, a od 1 lutego 2018 został zastępcą dowódcy 21 Brygady Strzelców Podhalańskich. W marcu 2020 objął dowodzenie 10 Brygadą Kawalerii Pancernej, następnie w 2021 stanowisko zastępcy szefa sztabu w Dowództwie Operacyjnym Sił Zbrojnych. 1 października 2023, oddelegowany do USA, jako drugi Polak w historii, objął stanowisko zastępcy dowódcy 1 Dywizji Kawalerii US Army.
Po zakończeniu tej misji, 14 maja 2026 odjął obowiązki Dowódcy Wielonarodowej Dywizji Północny Wschód. Generał Kowalik był również uczestnikiem XIX zmiany Polskiego Kontyngentu Wojskowego KFOR w Kosowie od września 2008 do marca 2009 roku.
